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＼第4回アンプラットセミナー開催！／

2024年8月28日（水）17:00 - 19:00

横浜ランドマークタワー７階

第4回アンプラットセミナーのご案内

題名：ANCAT解析無料体験講座

日時：2024年8月28日（水）17:00 – 19:00

場所：横浜ランドマークタワー7階

⚠当セミナーはオフラインのみの開催です。

後日ANCATにてアーカイブ配信を予定しております。

なお、開催当日に会場にてご参加いただきました方には

さまざまな特典をご用意してお待ちしております！

セミナー内容

本セミナーは、当社が開発した
データ解析技術共有プラットフォーム「ANCAT」を

実際に体験していただくセミナーです！

ご参加いただいた皆さまがお持ちのゲノムデータを

現在ANCATに登録されている多くの解析手法の中から
お選びいただき、実際に解析することが可能です。

実際に出力された解析結果についての解説も行います♪

ANCATとは？

当社で開発したデータ解析技術共有プラットフォームです！
「マウスクリックで専門知識なしに解析が実行できること」と

「クラウド上で解析可能なため、解析手法の共有が可能」な点が特徴です！

また、研究の支援をするためのポータルサイトとしての機能も持ち、

解析に関する疑問等を解決するチャットサポート機能や、
アンプラットセミナーのアーカイブ動画の閲覧できる機能など、さまざまな機能があります。

ANCATの詳細は下記をご覧ください！

ANCATはこちら

対象

研究者、解析に携わる方、学生の方、

ANCATに興味のある方

持ち物

解析したい「サンプルデータ」を入れたノートPC

※当日行う解析は下記よりお選びください。

※データはネットワークの関係上、上限5GBまででお願いいたします。

※解析にはネットワーク接続が必要です。会場ではゲストWi-Fiがご利用可能です。

体験可能な解析手法
  1. Draw phylogenetic tree using iqtree2
    （参考価格：550円〜）
    phylipやmulti-fastaなどからiqtree2を用いて系統樹を作成するツール
  2. Reseq for T2T-CHM13v2.0
    （参考価格：5,500円〜）
    ヒトのT2Tのゲノム（T2T-CHM13v2.0）を用いて変異解析および 変異へのアノテーションを行うツール
  3. Resequence
    （参考価格：5,500円〜）
    リファレンスゲノムを入力して変異解析を行うツール
  4. MutMap
    （参考価格：5,500円〜）
    突然変異形質の原因遺伝子を調べる手法
  5. VUS Annotator
    （参考価格：0円 - Open Analysisで公開中）
    F-Oneレポートに付随するVUSを記載したXMLに対して データベースを用いたアノテーションを行うツール
  6. MIG-Seq
    （参考価格：5,500円〜）
    簡易的なGWASおよび系統解析を行うためのツール
  7. Draw Manhattan and QQ plot from GWAS results
    （参考価格：550円〜）
    PLINKのped, mapからQQ-plotを作成するツール
  8. BAM to FASTQ converter
    （参考価格：1,100円〜）
    BAMの元となったfastqを生成するツール
  9. Coverage calculator
    （参考価格：550円〜）
    BAMの指定した領域でのCoverageを計算するツール
  10. Treemix
    （参考価格：550円〜）
    系統樹描画を行うツール
  11. SNPWorkFlow
    （参考価格：5,500円〜）
    Plant GARDENにあるゲノムを用いた変異解析を行うツール
  12. PCA
    （参考価格：0円 - Open Analysisで公開中）
    主成分分析を行うツール
  13. T and U test
    （参考価格：110円〜）
    T test / U testを行うツール
  14. RNA-seq
    （参考価格：5,500円〜）
    RNAの発現量解析を行うツール
  15. SARS-Cov-2 Blast
    （参考価格：1,100円〜）
    SARS-Cov-2のデータベースに対してfastaをblastするツール
  16. SARS-Cov-2-Classifier
    （参考価格：1,100円〜）
    S遺伝子上の変異から登録済みのSARS-Cov-2に分類を行うツール
  17. calculate chi-square value and P-value
    （参考価格：550円〜）
    multi-sample VCFから各変異のHardy-Weinberg平衡の chi-square, p-valueを計算するツール
  18. network visualization with pyvis
    （参考価格：550円〜）
    相関行列を計算してネットワークとヒートマップを描画する ツール
  19. Structural Variant caller
    （参考価格：5,500円〜）
    UCSCのhg38ゲノムにマップされたbamから構造変異を コールするツール
  20. Fastq Simulator
    （参考価格：1,100円〜）
    fastaおよびvcfから作成したコンセンサスfastaを用いてfastqを生成するツール
  21. Flare VCF Formatter
    （参考価格：550円〜）
    FlareによるアノテーションがあるVCFから、不確かな 祖先由来の遺伝子型をマスクするツール
  22. Variant Reflector
    （参考価格：550円〜）
    VCFファイル中の変異を反映したゲノムのcomplementary DNAのfasta及び、塩基ならびにアミノ酸の変異を記載したTSVを出力するツール
  23. Protein pocket detection by fpocket
    （参考価格：5,500円〜）
    fpocketを利用した非常に高速なタンパク質ポケット 検出
  24. NyanSeq
    （参考価格：5,500円〜）
    猫の変異解析を行うツール
  25. JonckheereTerpstra test
    （参考価格：110円〜）
    JonckheereTerpstra検定を実行するツール
  26. Radar Drawer from grib2
    （参考価格：0円 - Open Analysisで公開中）
    気象業務支援センターなどが配布している、レーダーによる雨量・積雪などの予報データについて、GMTを用いて予報雨量や積雪量などの2d contourを作成する
  27. Merge MS Matrix
    （参考価格：110円〜）
    MSの出力TSVに対して[Protein.Group・Protein.Ids・Protein.Names]の中から指定された列と同じ列を持つ行を各idのカウントについてマージするツール
  28. extract-samples-from-vcf
    （参考価格：550円〜）
    Multi-sample VCFから任意のサンプルを抽出するツール
  29. tSNE
    （参考価格：0円 - Open Analysisで公開中）
    多次元量の入力データから高次元のデータを圧縮して図示するツール
  30. Merge gVCF
    （参考価格：1,100円〜）
    gVCFやVCFを結合し、multi-sample VCFを生成するツール

今回体験できる解析以外にも多数の解析を取り揃えておりますので、
解析に困ったときはぜひ相談ください！！

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お申し込みについて

下記のお申し込みフォームよりお申し込みください。

お申し込み時は下記の内容をご入力ください。

①メールアドレス、②お名前、③ご所属、④体験したい解析手法

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チラシ

PDF形式でイベントのチラシもご用意しております。

下記のボタンより印刷、ダウンロードが可能です。

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開催場所

神奈川県横浜市西区みなとみらい2-2-1

横浜ランドマークタワー7階

みなさまとお会いできることを楽しみにしています！

前回ご参加いただいた方はスタンプカードも是非ご持参ください♪

@2024 ANPLAT Co., Ltd.