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アンプラットの役員が皆様の研究・業務に役立つセミナーを開催予定です。

現在参加申し込み受付中のセミナーは下記の通りです。

2024年8月28日(水) 17:00 ~ 19:00
「ANCAT解析無料体験講座」

体験可能な解析手法の詳細は下記よりご確認ください。

  1. Draw phylogenetic tree using iqtree2
    (参考価格:550円〜)
    phylipやmulti-fastaなどからiqtree2を用いて系統樹を作成するツール
  2. Reseq for T2T-CHM13v2.0
    (参考価格:5,500円〜)
    ヒトのT2Tのゲノム(T2T-CHM13v2.0)を用いて変異解析および 変異へのアノテーションを行うツール
  3. Resequence
    (参考価格:5,500円〜)
    リファレンスゲノムを入力して変異解析を行うツール
  4. MutMap
    (参考価格:5,500円〜)
    突然変異形質の原因遺伝子を調べる手法
  5. VUS Annotator
    (参考価格:0円 – Open Analysisで公開中)
    F-Oneレポートに付随するVUSを記載したXMLに対して データベースを用いたアノテーションを行うツール
  6. MIG-Seq
    (参考価格:5,500円〜)
    簡易的なGWASおよび系統解析を行うためのツール
  7. Draw Manhattan and QQ plot from GWAS results
    (参考価格:550円〜)
    PLINKのped, mapからQQ-plotを作成するツール
  8. BAM to FASTQ converter
    (参考価格:1,100円〜)
    BAMの元となったfastqを生成するツール
  9. Coverage calculator
    (参考価格:550円〜)
    BAMの指定した領域でのCoverageを計算するツール
  10. Treemix
    (参考価格:550円〜)
    系統樹描画を行うツール
  11. SNPWorkFlow
    (参考価格:5,500円〜)
    Plant GARDENにあるゲノムを用いた変異解析を行うツール
  12. PCA
    (参考価格:0円 – Open Analysisで公開中)
    主成分分析を行うツール
  13. T and U test
    (参考価格:110円〜)
    T test / U testを行うツール
  14. RNA-seq
    (参考価格:5,500円〜)
    RNAの発現量解析を行うツール
  15. SARS-Cov-2 Blast
    (参考価格:1,100円〜)
    SARS-Cov-2のデータベースに対してfastaをblastするツール
  16. SARS-Cov-2-Classifier
    (参考価格:1,100円〜)
    S遺伝子上の変異から登録済みのSARS-Cov-2に分類を行うツール
  17. calculate chi-square value and P-value
    (参考価格:550円〜)
    multi-sample VCFから各変異のHardy-Weinberg平衡の chi-square, p-valueを計算するツール
  18. network visualization with pyvis
    (参考価格:550円〜)
    相関行列を計算してネットワークとヒートマップを描画する ツール
  19. Structural Variant caller
    (参考価格:5,500円〜)
    UCSCのhg38ゲノムにマップされたbamから構造変異を コールするツール
  20. Fastq Simulator
    (参考価格:1,100円〜)
    fastaおよびvcfから作成したコンセンサスfastaを用いてfastqを生成するツール
  21. Flare VCF Formatter
    (参考価格:550円〜)
    FlareによるアノテーションがあるVCFから、不確かな 祖先由来の遺伝子型をマスクするツール
  22. Variant Reflector
    (参考価格:550円〜)
    VCFファイル中の変異を反映したゲノムのcomplementary DNAのfasta及び、塩基ならびにアミノ酸の変異を記載したTSVを出力するツール
  23. Protein pocket detection by fpocket
    (参考価格:5,500円〜)
    fpocketを利用した非常に高速なタンパク質ポケット 検出
  24. NyanSeq
    (参考価格:5,500円〜)
    猫の変異解析を行うツール
  25. JonckheereTerpstra test
    (参考価格:110円〜)
    JonckheereTerpstra検定を実行するツール
  26. Radar Drawer from grib2
    (参考価格:0円 – Open Analysisで公開中)
    気象業務支援センターなどが配布している、レーダーによる雨量・積雪などの予報データについて、GMTを用いて予報雨量や積雪量などの2d contourを作成する
  27. Merge MS Matrix
    (参考価格:110円〜)
    MSの出力TSVに対して[Protein.Group・Protein.Ids・Protein.Names]の中から指定された列と同じ列を持つ行を各idのカウントについてマージするツール
  28. extract-samples-from-vcf
    (参考価格:550円〜)
    Multi-sample VCFから任意のサンプルを抽出するツール
  29. tSNE
    (参考価格:0円 – Open Analysisで公開中)
    多次元量の入力データから高次元のデータを圧縮して図示するツール
  30. Merge gVCF
    (参考価格:1,100円〜)
    gVCFやVCFを結合し、multi-sample VCFを生成するツール

*は必須項目ですので必ず入力してください。


    開催場所

    神奈川県横浜市西区みなとみらい2-2-1

    横浜ランドマークタワー7階

    @2024 ANPLAT Co., Ltd.