- プログラミングやコードの知識が無くて解析が思うように出来ない
- 解析環境の準備に時間がかかる
- 他の研究者と手法を共有したいけど難しい.... などなど!
Online Public Access Analytical Catalog (ANCAT)
「解析が難しい」「環境構築が面倒」——そんな悩みを解決!
インターネットがあれば、誰でもすぐに解析が実行できる
研究者のための解析プラットフォームです。
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無料でANCATに登録可能!
「まずは触ってみたい」も大歓迎です。
一部の解析は無料で利用できます!
(※無料公開中の解析は表の一覧をご確認ください)
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繰り返し解析したい人向けの定額プラン!
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大学・研究室・企業研究者さん向けに請求書払いにも対応しています。
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「手持ちの解析スクリプトをANCATに載せたい!」
→ 1手法 5万円〜(内容により変動)
「このスクリプト、変じゃない?」
→ 1手法 3万円〜
| 解析名 | 詳細 | 参考価格 |
|---|---|---|
| Draw phylogenetic tree using iqtree2 | phylipやmulti-fastaなど⇒iqtree2を用いて系統樹を作成するツール | 550円〜 |
| Reseq for T2T-CHM13v2.0 | ヒトのT2Tゲノム(T2T-CHM13v2.0)を用いて変異探索および変異へのアノテーションを行うツール | 5,500円〜 |
| Resequence | リファレンスゲノムを入力して変異探索を行うツール | 5,500円〜 |
| MutMap | 突然変異体の原因変異領域を特定する手法 | 5,500円〜 |
| VUS Annotator | F-Oneレポート上で付随するVUSを確認しながらXML形式でデータベースを用いたアノテーションを行うツール | 無料公開中 |
| MIG-Seq | 簡易的なGWASおよび系統解析を行うためのツール | 1,500円〜 |
| Draw Manhattan and QQ plot from GWAS results | PLINKのped、mapからQQ-plotを作成するツール | 5,500円〜 |
| BAM to FASTQ converter | BAMの元となったfastqを生成するツール | 1,100円〜 |
| Coverage calculator | BAMの指定した領域でのCoverageを計算するツール | 550円〜 |
| Treemix | 系統構造解析ツール | 5,500円〜 |
| SNPWorkFlow | Plant GARDENにあるゲノムを用いた変異解析を行うツール | 5,500円〜 |
| PCA | 主成分分析を行うツール | 無料公開中 |
| T and U test | T test / U testを行うツール | 110円〜 |
| RNA-seq | RNAの発現量解析を行うツール | 1,100円〜 |
| SARS-Cov-2 Blast | SARS-Cov-2のデータベースに対してblastを行うツール | 550円〜 |
| SARS-Cov-2-classifier | 塩基データ上で変異解析およびSARS-Cov-2に分類するツール | 550円〜 |
| calculate chi-square value and P-value | multi-sample VCFから各変異のHardy-Weinberg平衡のchi-square、p-valueを計算するツール | 550円〜 |
| network visualization with pyvis | 相関行列を計算してネットワークとヒートマップを描画するツール | 550円〜 |
| Structural Variant caller | UCSCのhg38デノボアセンブリされたbamから構造変異をコールするツール | 5,500円〜 |
| Fastq Simulator | fastaおよびvcfから任意レベルでエラーベクトルを入力してfastqを作成するツール | 1,100円〜 |
| Flare VCF Formatter | Flareによるアノテーションがあるvcfから、ルールに基づいた任意の表記形式へ変換するツール | 550円〜 |
| Variant Reflector | VCFファイル中の変異を反映しゲノム配列を作成し、反映された領域に対してONAのfastaおよびレポートを出力するツール | 550円〜 |
| Protein pocket detection by fpocket | fpocketを利用して高速なタンパク質ポケット検出 | 5,500円〜 |
| NyanSeq | 猫の変異解析を行うツール | 550円〜 |
| JonckheereTerpstra test | JonckheereTerpstra検定を行うツール | 550円〜 |
| Radar Drawer from grib2 | レーダー雨量・積雪を平年比でGMTにて図示するツール | 無料公開中 |
| Merge MS Matrix | Protein.Groupなどを基準に列を結合しデータ整形するツール | 110円〜 |
| extract-samples-from-vcf | Multi-sample VCFから任意のサンプルを抽出するツール | 550円〜 |
| tSNE | 高次元データを可視化するツール | 無料公開中 |
| Merge gVCF | gVCFを結合してmulti-sample VCFを作成するツール | 550円〜 |
phylipやmulti-fastaなど⇒iqtree2を用いて系統樹を作成するツール
💰参考価格:550円
ヒトのT2Tゲノム(T2T-CHM13v2.0)を用いて変異探索および変異へのアノテーションを行うツール
💰参考価格:5,500円〜
リファレンスゲノムを入力して変異探索を行うツール
💰参考価格:5,500円〜
突然変異体の原因変異領域を特定する手法
💰参考価格:5,500円〜
F-Oneレポート上で付随するVUSを確認しながらXML形式でデータベースを用いたアノテーションを行うツール
🆓無料公開中!
簡易的なGWASおよび系統解析を行うためのツール
💰参考価格:1,500円〜
PLINKのped、mapからQQ-plotを作成するツール
💰参考価格:5,500円〜
BAMの元となったfastqを生成するツール
💰参考価格:1,100円〜
BAMの指定した領域でのCoverageを計算するツール
💰参考価格:550円
系統構造解析ツール
💰参考価格:5,500円〜
Plant GARDENにあるゲノムを用いた変異解析を行うツール
💰参考価格:5,500円〜
主成分分析を行うツール
🆓無料公開中!
T test / U testを行うツール
💰参考価格:110円〜
RNAの発現量解析を行うツール
💰参考価格:1,100円〜
SARS-Cov-2のデータベースに対してblastを行うツール
💰参考価格:550円
塩基データ上で変異解析およびSARS-Cov-2に分類するツール
💰参考価格:550円
multi-sample VCFから各変異のHardy-Weinberg平衡のchi-square、p-valueを計算するツール
💰参考価格:550円
相関行列を計算してネットワークとヒートマップを描画するツール
💰参考価格:550円
UCSCのhg38デノボアセンブリされたbamから構造変異をコールするツール
💰参考価格:5,500円〜
fastaおよびvcfから任意レベルでエラーベクトルを入力してfastqを作成するツール
💰参考価格:1,100円〜
Flareによるアノテーションがあるvcfから、ルールに基づいた任意の表記形式へ変換するツール
💰参考価格:550円
VCFファイル中の変異を反映しゲノム配列を作成し、反映された領域に対してONAのfastaおよびレポートを出力するツール
💰参考価格:550円
fpocketを利用して高速なタンパク質ポケット検出
💰参考価格:5,500円〜
猫の変異解析を行うツール
💰参考価格:550円
JonckheereTerpstra検定を行うツール
💰参考価格:550円
レーダー雨量・積雪を平年比でGMTにて図示するツール
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Protein.Groupなどを基準に列を結合しデータ整形するツール
💰参考価格:110円〜
Multi-sample VCFから任意のサンプルを抽出するツール
💰参考価格:550円〜
高次元データを可視化するツール
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gVCFを結合してmulti-sample VCFを作成するツール
💰参考価格:550円〜
ここに記載しきれていない解析もたくさんございますので、まずはお気軽にお問い合わせください!ここに記載しきれていない解析もたくさんございますので、まずはお気軽にお問い合わせください!
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