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アンプラットの役員が皆様の研究・業務に役立つセミナーを開催予定です。

現在参加申し込み受付中のセミナーは下記の通りです。

2024年12月18日(水) 17:00 ～ 19:00
「ANCAT解析無料体験講座」

詳細はこちら

体験可能な解析手法の詳細は下記よりご確認ください。

  1. Draw phylogenetic tree using iqtree2
    （参考価格：550円〜）
    phylipやmulti-fastaなどからiqtree2を用いて系統樹を作成するツール
  2. Reseq for T2T-CHM13v2.0
    （参考価格：5,500円〜）
    ヒトのT2Tのゲノム（T2T-CHM13v2.0）を用いて変異解析および 変異へのアノテーションを行うツール
  3. Resequence
    （参考価格：5,500円〜）
    リファレンスゲノムを入力して変異解析を行うツール
  4. MutMap
    （参考価格：5,500円〜）
    突然変異形質の原因遺伝子を調べる手法
  5. VUS Annotator
    （参考価格：0円 – Open Analysisで公開中）
    F-Oneレポートに付随するVUSを記載したXMLに対して データベースを用いたアノテーションを行うツール
  6. MIG-Seq
    （参考価格：5,500円〜）
    簡易的なGWASおよび系統解析を行うためのツール
  7. Draw Manhattan and QQ plot from GWAS results
    （参考価格：550円〜）
    PLINKのped, mapからQQ-plotを作成するツール
  8. BAM to FASTQ converter
    （参考価格：1,100円〜）
    BAMの元となったfastqを生成するツール
  9. Coverage calculator
    （参考価格：550円〜）
    BAMの指定した領域でのCoverageを計算するツール
  10. Treemix
    （参考価格：550円〜）
    系統樹描画を行うツール
  11. SNPWorkFlow
    （参考価格：5,500円〜）
    Plant GARDENにあるゲノムを用いた変異解析を行うツール
  12. PCA
    （参考価格：0円 – Open Analysisで公開中）
    主成分分析を行うツール
  13. T and U test
    （参考価格：110円〜）
    T test / U testを行うツール
  14. RNA-seq
    （参考価格：5,500円〜）
    RNAの発現量解析を行うツール
  15. SARS-Cov-2 Blast
    （参考価格：1,100円〜）
    SARS-Cov-2のデータベースに対してfastaをblastするツール
  16. SARS-Cov-2-Classifier
    （参考価格：1,100円〜）
    S遺伝子上の変異から登録済みのSARS-Cov-2に分類を行うツール
  17. calculate chi-square value and P-value
    （参考価格：550円〜）
    multi-sample VCFから各変異のHardy-Weinberg平衡の chi-square, p-valueを計算するツール
  18. network visualization with pyvis
    （参考価格：550円〜）
    相関行列を計算してネットワークとヒートマップを描画する ツール
  19. Structural Variant caller
    （参考価格：5,500円〜）
    UCSCのhg38ゲノムにマップされたbamから構造変異を コールするツール
  20. Fastq Simulator
    （参考価格：1,100円〜）
    fastaおよびvcfから作成したコンセンサスfastaを用いてfastqを生成するツール
  21. Flare VCF Formatter
    （参考価格：550円〜）
    FlareによるアノテーションがあるVCFから、不確かな 祖先由来の遺伝子型をマスクするツール
  22. Variant Reflector
    （参考価格：550円〜）
    VCFファイル中の変異を反映したゲノムのcomplementary DNAのfasta及び、塩基ならびにアミノ酸の変異を記載したTSVを出力するツール
  23. Protein pocket detection by fpocket
    （参考価格：5,500円〜）
    fpocketを利用した非常に高速なタンパク質ポケット 検出
  24. NyanSeq
    （参考価格：5,500円〜）
    猫の変異解析を行うツール
  25. JonckheereTerpstra test
    （参考価格：110円〜）
    JonckheereTerpstra検定を実行するツール
  26. Radar Drawer from grib2
    （参考価格：0円 – Open Analysisで公開中）
    気象業務支援センターなどが配布している、レーダーによる雨量・積雪などの予報データについて、GMTを用いて予報雨量や積雪量などの2d contourを作成する
  27. Merge MS Matrix
    （参考価格：110円〜）
    MSの出力TSVに対して[Protein.Group・Protein.Ids・Protein.Names]の中から指定された列と同じ列を持つ行を各idのカウントについてマージするツール
  28. extract-samples-from-vcf
    （参考価格：550円〜）
    Multi-sample VCFから任意のサンプルを抽出するツール
  29. tSNE
    （参考価格：0円 – Open Analysisで公開中）
    多次元量の入力データから高次元のデータを圧縮して図示するツール
  30. Merge gVCF
    （参考価格：1,100円〜）
    gVCFやVCFを結合し、multi-sample VCFを生成するツール

*は必須項目ですので必ず入力してください。


    開催場所

    神奈川県横浜市西区みなとみらい2-2-1

    横浜ランドマークタワー7階

    @2024 ANPLAT Co., Ltd.